温度是影响厌氧微生物生命活动的重要因素之一。并且在废水厌氧生物处理设备运行中，要维持一定的反应温度又与能耗和处理成本有关。与所有的化学反应和生物化学反应一样，厌氧生物降解过程也受到温度和温度波动的影响，主要表现在以下三点：
(1)温度会影响有机物在生化反应中的流向和某些中间产物的形成，因而与沼气的产量与成分等有关。
(2)温度通过影响厌氧微生物体内某些酶的活性而影响微生物的生长速率和微生物对基质的代谢速率，因而会影响到废水厌氧生物处理工艺中污泥的产生量和有机物的去除速率。
(3)温度还可能影响污泥的成分与性状。
