采用软性填料生物膜法当时虽然在实验室取得了很好的效果，但刚应用于工程上时却出现了很多问题，那时填料是安装在填料框中的，用硬质塑料作框架，这样的本意是为了防腐和便于更换填料。但当填料上挂满生物膜并曝气时，会出现填料框移位，曝气量大时整个框架会上浮。此后就对填料框作了改进，填料框的边框采用圆型塑料管，放至水中后水就注入管内，经改进后相对来说情况有所好转，但当生物过厚需要大气量冲刷时仍会造成填料框移位。还有一个问题是当曝气池需放空时，如放水量稍大，填料框易变形甚至倒塌。因为挂满生物膜的填料框一旦失去水的浮力时很容易出现这样的情况。所以现在填料通常都固定安装在池上下端的铁管上。
